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RedeVírus-MCTI informa sobre a detecção de circulação da variante B.1.621, recentemente isolada na Colômbia.
INFORME N. 24 REDE CORONA-ÔMICA.BR-MCTI
A Rede Vírus MCTI informa que a Rede Corona-Ômica.BR-MCTI, por meio do CT-Vacinas da Universidade Federal de Minas Gerais, em parceria com a Funed, tem buscado a caracterização de variantes do SARS-CoV-2 utilizando a metodologia de Sanger. O sequenciamento de amplicons de 1006 pb e de 393 pb correspondentes à duas regiões da proteína Spike contendo a sequência ligante do receptor celular (RBD) permite a identificação de mutações específicas presentes em variantes circulantes em vários países e que resultam nas mudanças de aminoácidos como mostrado na Tabela 1.
O sequenciamento de cinco amostras de swab nasofaríngeo positivas no teste de RT-PCR, proveniente de indivíduos das cidades de Virginopolis (3) e Guanhães (2), Minas Gerais e coletadas/enviadas para testagem entre os dias 13 de julho e 5 de agosto, revelou a presença das mutações R346K, E484K, N501Y, D614G e P681H, identificadas na variante B.1.621, uma VOI recentemente isolada na Colômbia.
Recomendamos, portanto que as providências cabíveis sejam tomadas pelos órgãos estaduais e federais competentes no controle da dispersão das variantes do SARSCoV-2 em território brasileiro e agradecemos a colaboração dos laboratórios envolvidos.
Tabela 1: Alterações de aminoácidos presentes nos fragmentos amplificados, em comparação com a sequencia de aminoácidos da porção RBD presente na linhagem originalmente isolada em Wuhan.
Variante |
Mutações nos fragmentos amplificado |
P.1 – Gamma |
K417T |
E484K |
|
N501Y |
|
D614G |
|
B.1.1.77 – Alpha |
N501Y |
A570D |
|
D614G |
|
B.1.351- Beta |
K417N |
E484K |
|
N501Y |
|
D614G |
|
B.1.617.2 – Delta |
L452R |
T478K |
|
D614G |
|
P681R |
|
B.1.621 |
R346K |
E484K |
|
N501Y |
|
D614G |
|
P681H |
Rede Corona-Ômica.BR-MCTI