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REDEVÍRUS MCTI
Variantes P1 e P2 circulavam em cidades da região de São José do Rio Preto - SP em Janeiro de 2021, com predomínio de P2
A Rede Vírus MCTI informa que a Rede Corona-ÔmicaBR-MCTI, através do Instituto de Biotecnologia (IBTEC) e Instituto de Biociências - UNESP Botucatu, do Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE) - UNESP, São José do Rio Preto, do Laboratório de Vírus da Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP) e da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da USP Pirassununga (FZEA), sequenciou parte do segmento codificante da proteína S de SARS-CoV-2 através da técnica de Sanger que possibilitou identificar as principais variantes.
Com os resultados foi possível identificar que em Janeiro de 2021 a variante P1 (Brasileira) circulava na cidade de São José do Rio Preto – SP. Também verificamos a circulação da variante P2 (Brasileira), no mesmo período, em São José do Rio Preto – SP e outras 7 cidades da região (Bady Bassitt, Guapiaçu, Ibirá, Jaci, José Bonifácio, Mirassol e Olímpia.
Também foram identificadas duas mutações não sinônimas em duas amostras distintas da cidade de Palestina – SP. A mutação N439K é causada pela substituição nucleotídica C1317G e se encontra na região RBM (Receptor Binding Motif) que está localizada dentro da região RBD (Receptor Binding Domain). Já a segunda mutação V382L, causada pela substituição nucleotídica G1144T, encontra-se em RBD, fora de RBM. Ambas foram identificadas em sequencias que não apresentavam outras mutações na região analisada da proteína Spike.
Cidade |
Nº amostras |
Data da coleta |
Variante |
Mutações (Apenas em S – parcial) |
São José do Rio Preto -SP |
2 |
Jan/2021 |
P1 |
Spike K417T Spike E484K, Spike N501Y, |
São José do Rio Preto -SP |
15 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
Bady Bassitt - SP |
2 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
Guapiaçu -SP |
1 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
Ibirá - SP |
2 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
Jaci - SP |
2 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
José Bonifácio - SP |
2 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
Mirassol - SP |
1 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
Olímpia -SP |
2 |
Jan/2021 |
P2 |
Spike E484K |
Todos os dados estão sendo disponibilizados em bases de dados públicos nacionais (CoronaÔmica.BR – MCTI) e internacionais (GISAID) com a posterior submissão do trabalho ao periódico científico.
Desta forma, recomendamos, que as providências cabíveis sejam tomadas pelos órgãos estaduais e federais competentes no controle da dispersão das variantes de SARS-CoV-2 em território brasileiro.
Rede Corona-Ômica.BR-MCTI