LABINFO/LNCC tem artigo publicado em revista internacional

Estudo realizado no Laboratório de Bioinformática do Laboratório Nacional de Computação Científica – LNCC (unidade de pesquisa vinculada ao Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovações – MCTI) sequenciou o genoma completo de 185 amostras isoladas do vírus da covid-19 de três das cinco regiões brasileiras, incluindo Amazonas (região Norte), Rio Grande do Norte, Paraíba e Bahia (região Nordeste) e Rio de Janeiro (Sudeste) a fim de monitorar a disseminação das linhagens de SARS-CoV-2 no Brasil nos primeiros meses de 2021. O estudo contou com colaboração de diversas instituições, como a Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Universidade Federal da Paraíba, Universidade do Estado do Rio de Janeiro e Universidade Estadual de Santa Cruz e teve seu resultado publicado recentemente na revista internacional Plos Neglected Tropical Disease.

A pesquisa demonstra uma ampla dispersão de P.1 (variante Gamma) e P.2 (variante Zeta) nas regiões brasileiras. Exceto no Amazonas, a P.2 foi a linhagem predominante identificada. Estima-se que a origem da linhagem P.2 tenha ocorrido em fevereiro de 2020 e identificou-se que ela se diferenciou em novas sublinhagens. A transmissão interestadual de P.2 foi detectada desde março, mas atingiu seu pico em dezembro de 2020 e janeiro de 2021. A transmissão de P.1 também foi alta em dezembro e sua origem foi inferida como tendo ocorrido em agosto de 2020. O estudo confirmou a presença da linhagem P.7 nos estados do Nordeste. Ela havia sido descrita originalmente na região mais ao sul do Brasil. 

P.1, P.2 e P.7 são descendentes da cepa B.1.1.28, que co-dominou a primeira fase da pandemia no Brasil com a cepa B.1.1.33. Também se identificou a ocorrência de uma nova linhagem descendente de B.1.1.33 convergentemente carrega a mutação E484K, N.9. 

O estudo relata que a ocorrência de muitas variantes genéticas do SARS-CoV-2 no Brasil pode ser devido à ausência de medidas de controle eficazes, resultando em altas taxas de transmissão. Finalmente, os resultados do estudo fornecem um panorama do estado crítico do SARS-CoV-2 em todo o Brasil e confirmam a necessidade de manter o sequenciamento contínuo de amostras em todo o mundo para identificar novas variantes de interesse e monitorar a eficácia da vacina.

Acesse o artigo na íntegra em https://journals.plos.org/plosntds/article?id=10.1371/journal.pntd.0009835