LABINFO/LNCC publica artigo que propõe ferramenta desenvolvida para analisar dados de Covid-19

O trabalho desenvolvido pelos pesquisadores do Laboratório de Bioinformática – LABINFO do Laboratório Nacional de Computação Científica – LNCC (unidade de pesquisa do Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovações – MCTI) propõe uma ferramenta (EpiCurator) para seleção mais acurada de epítopos, a partir das informações genéticas do novo coronavírus. Epítopos são fragmentos das proteínas virais que podem aumentar a imunidade do indivíduo, ajudando no combate à COVID-19.

Dessa forma, foi proposta uma abordagem que combina um conjunto de análises de bioinformática amplamente discutidas e caracterizadas por diversos grupos de pesquisa para identificação desses epítopos, junto com análises inovadoras que permitem a seleção de fragmentos das proteínas virais presentes em diferentes variantes do novo coronavírus e nunca antes descritos em outros estudos. A ferramenta gera um resultado com número restrito e acurado de possíveis candidatos, o que diminui o custo da validação experimental necessária para comprovar ou não a sua eficiência em sistemas biológicos.

O trabalho usou genomas sequenciados no Brasil, a fim de comprovar a eficiência da ferramenta e priorizar seu uso por pesquisadores brasileiros. Contudo, as análises podem ser aplicadas independente do país de origem das amostras, o que amplia a possibilidade do uso da ferramenta por qualquer grupo de pesquisa internacional. As vantagens do uso da ferramenta incluem sua capacidade de identificar computacionalmente novos novos fragmentos de proteínas capazes de ser reconhecido pelas nossas células de defesa e gerar uma resposta imune específica contra o vírus, aumentando assim sua eficiência no combate à COVID-19.

O trabalho desenvolvido poderá contribuir para a identificação contínua de epítopos que possam surgir com novas variantes do novo coronavírus, o que oferece uma vantagem para os grupos de pesquisa que desenvolvem vacinas.

Para acessar o artigo na íntegra, acesse https://peerj.com/articles/12548/