Genômica
A unidade Genômica fornece dados de sequenciamento de ácidos nucléicos aos pesquisadores da instituição e, em colaboração, a outras instituições de pesquisa do país. Fornece dados de sequência de regiões genômicas específicas pela metodologia de Sanger, ou sequências para genomas ou transcriptomas completos utilizando metodologias de sequenciamento por síntese (Next Generation Sequencing). Fornece também dados necessários a análise de fragmentos para identificação de variação de número de cópias ou identificação de variantes genéticas. Utilizando a plataforma de microarranjo pode-se gerar dados de análise simultânea de genomas com respeito a variação no número de cópias, polimorfismos de sequências únicas, expressão gênica global.
Responsável pela plataforma:
Carolina Furtado Torres da Silva (Lattes)
Tecnologista
Email: cfurtado@inca.gov.br
Telefone: +55 21 32076514
Lista de equipamentos:
- Plataforma de Microarranjo Affymetrix para análise genômica de variações no número de cópias, expressão gênica global e identificação de variantes genéticas.
- Sequenciadores capilar 3130xl Genetic Analyzer, que permite obter dados de sequenciamento de Sanger para 16 amostras simultaneamente, ou analisar padrões de fragmentos de DNA para 16 amostras simultaneamente.
- Sequenciador Capilar 3730xl Genetic Analyzer, que permite obter dados de sequenciamento de Sanger para 96 amostras simultaneamente, ou analisar padrões de fragmentos de DNA para 96 amostras simultaneamente.
- Sequenciador por síntese Illumina HiSeq 2500, que permite o sequenciamento de genomas e transcriptomas, ou a análise simultânea de vários alvos genômicos (target sequencing) de 1536 amostras biológicas diferentes.
- Sequenciador Illumina MiSeq, que permite o sequenciamento de pequenos genomas, ressequenciamento de alvos genômicos (target resequencing), análises de expressão gênica de alvos definidos, etc.
Utilização:
Os usuários deverão contactar a reponsável para agendar uma reunião, quando serão apresentados os detalhes para a utilização da plataforma.
Localização:
Instituto Nacional de Câncer
Coordenação de Pesquisa
Rua André Cavalcanti, 37, 4º andar
Centro, Rio de Janeiro
CEP: 20231-050