A Coordenação Regional Araguaia Tocantins está localizada no município de  Palmas (TO) e atua junto aos povos indígenas das etnias Apinajé, Krahô, Xerente, Xerente do Araguaia, Karajá, Karajá de Aruanã, Karajá Xambioá, Karajá Santana do Araguaia, Javaé, Tapuia, Tapirapé, Krenak-Maxakali, Krahô-Kanela, Krahô (Takaywrá), Kanela do Tocantins, Kanela do Araguaia, Avá Canoeiro, Fulniô, Guarani e Guajajara. Criada em 2009, a unidade é responsável por coordenar e monitorar a implementação de ações de proteção e promoção dos direitos de povos indígenas em uma região que abrange os estados de Tocantins, Goiás, Mato Grosso, Pará e Maranhão.