Programa de Proteção à Flora
Subprograma de Controle da Supressão da Vegetação
A execução desse subprograma possibilita a proteção florestal e a minimização dos impactos ambientais tanto pela aplicação de procedimentos em relação à supressão da vegetação, para que esta ocorra apenas dentro das áreas demarcadas e sinalizadas, como através da orientação aos trabalhadores responsáveis pelo empilhamento do material lenhoso, estoque de material residual de vegetação e solo superficial.
Subprograma de Monitoramento e Conservação da Flora
Os impactos e processos adaptativos da vegetação remanescente devem ser acompanhados e monitorados, através de vistorias e avaliações de parâmetros já definidos, de forma que esteja sempre em foco a conservação, preservação e proteção das espécies da flora local.
Subprograma de Resgate de Germoplasma, incluindo epífitas e espécies ameaçadas
Para que seja mínima a perda populacional nos remanescentes de vegetação nativa de Mata Atlântica e as áreas degradadas pela rodovia sejam recuperadas, aplica-se este subprograma. Nele, são realocados propágulos, espécimes e plântulas, além da coleta de sementes para germinação e propagação em viveiros.